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基于颜色判定的环介导等温扩增方法检测EV71
【出 处】:
逆转录-环介导等温扩增技术
肠道病毒71型
手足口病
【作 者】:
戴颖
[1] ;
刘峰涛
[2] ;
何书
[1] ;
汪奇伟
[1]
【摘 要】建立了一种基于颜色判定的灵敏、快速和经济的逆转录环介导等温扩增(reversetranscriptionloop-mediatedisother-realamplification,RT-LAMP)方法应用于肠道病毒71(enterovirus71,EV71)基因检测。针对EV71病毒VP1基因特异性序列的设计出6条特异引物,在等温条件下(63℃)进行扩增反应60min。在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为反应指示剂,以其颜色变化作为结果判断标准。进行特异性/灵敏度分析,同时与RT-PCR方法进行比较,并对93份疑似患者中咽拭子的病毒核酸进行了检测。通过颜色变化能观察到LAMP扩增产物的存在,且与柯萨奇病毒A16型(CA16)、轮状病毒、诺如病毒无交叉反应发生。所建立的RT-LAMP检测方法灵敏,灵敏度为500copy/tube,与定量PCR灵敏度相同。93份咽拭子标本中,RT-LAMP检测为46份阳性,荧光定量PCR检测有为44份阳性,二者统计学无显著差异。RT-LAMP是一种快速、敏感、特异、经济的方法,适合用于基层医疗机构临床检测。
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